【小鼠大学问】你找到Safe Harbor了吗?


什么是Safe Harbor?

20 世纪 90 年代末 Philipe Soriano 及其同事发现,一个被命名为 ROSAβgeo26 的随机转基因小鼠品系在所有组织中都能检测到高水平的β半乳糖苷酶表达。他们对这种转基因小鼠进行了基因插入的定位,确定了在第6号染色体的基因整合,也就是我们现在常说的Rosa26位点。虽然带有外源插入片段的纯合子小鼠的出生率略低于杂合子幼崽,但纯合子小鼠也能正常发育和繁殖,对小鼠和细胞无害。自此,Rosa26位点被用于基因安全敲入并能保证转入基因的正常稳定表达。「Safe Harbor 」安全港位点的概念由此被普及。

除了Rosa26以外,还有哪些位点可以安全地进行外源基因插入并高效表达呢?

已经有多个可用于哺乳动物外源基因插入的基因组「Safe Harbor」被发现并应用到人、小鼠、大鼠、兔子、猪的可调控或可逆基因过表达,例如:AAVS1、CCR5、HPRT、H11、Col1a1、TIGRE等等。


H11位点

H11位点(也叫Hipp11)位于小鼠第11号染色体,是 Eif4enif1与Drg1 这两个基因之间的一个位点,由 Simon Hippenmeyer于2010 年发现并命名。由于H11位点位于两个基因之间,故外源基因插入后影响內源基因表达的风险很小。同时H11位点所在的Eif4enif1与Drg1这两个基因的侧翼序列区域具有广泛的空间和时间EST(expression sequence tag)表达模式,能够使整合在此的外源基因受指定启动子的驱动而稳定表达。该位点的纯合敲入小鼠可正常发育和繁殖。因此成为可与Rosa26位点相媲美的新「Safe Harbor」。

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图1.The H11 genomic locus in cytoband A1 (~3 cM) between Eif4enif1 and Drg1 genes.

和Rosa26位点的过表达模型一样,在H11位点我们也可以采用CRISPR/Cas9技术构建条件性基因过表达小鼠模型,即广泛型强启动子pCAG与外源目的基因cDNA之间用loxP-STOP-loxP结构隔开,只有与组织特异性Cre工具鼠交配后,才会在特异细胞或组织中表达目的基因。

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图2. H11位点定点过表达示意图。


Col1a1位点

Col1a1位点是2006年由Caroline Beard首先使用作为四环素诱导调控外源基因表达的整合位点。Col1a1位点实际上位于第11号染色体的Col1a1基因3‘UTR下游约500bp左右。在四环素调控模型中,在TetO启动子之前往往加上SA-polyA来阻隔上游启动子的影响,防止不依赖于四环素的转录调控。

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图3. Col1a1定点插入位点示意图。

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图4. Col1a1位点四环素调控可逆过表达模式图。

例如,Col1a1-tetO-EGFP与Rosa26启动子驱动的rtTA工具鼠交配后,通过dox诱导,在小鼠体内可高效诱导EGFP的表达,且EGFP的表达谱与Rosa26启动子表达谱相一致。不过值得注意的是,在骨骼肌、脑组织和睾丸组织中没有EGFP的表达,后两者可能是由于血脑屏障和血睾屏障的关系。

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图5. Col1a1位点dox诱导EGFP表达情况。

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图6. Col1a1位点dox诱导EGFP表达概况表。


TIGRE位点

TIGRE是tightlyregulated 的缩写,也是一个适用于四环素调控的整合位点,位于小鼠第9号染色体AB124611 和 Carm1两个基因之间。

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图7. Chromosomal location of the T1 TIGRE locus.

TIGRE-TetO-LacZ与MMTV-tTA工具鼠交配后,在大多数主要组织脏器中,都可以检测到报告基因LacZ的表达。

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图8. Gene regulation in mice generated from tightly regulated ES clones.

和Col1a1位点类似,最好在TetO-cDNA-polyA两侧加上隔离子来减少不依赖于四环素的本底表达。

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图9. The ApoE TIGRE locus contains an exogenous copy of ApoE cDNA driven by TRE and flanked by four copies of chicken b-globin insulator (ins) sequences, two on each side, and a PGK promoter (P) driven loxneo selection marker.

好的,常用的定点整合位点(Safe Harbors)先给大家普及这么多,如果想要了解更多可以在下方留言区互动,也可在公众号内回复「学问」,查看更多小鼠大学问系列干货!

References

1. Zambrowicz BP, Imamoto A, et al.Disruption of overlapping transcripts in the ROSA beta geo 26 gene trap strain leads to widespread expression of beta-galactosidase in mouse embryos and hematopoietic cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 1997 Apr 15;94(8):3789-94.

2. Hippenmeyer S , Youn YH , et al. Genetic Mosaic Dissection of Lis1 and Ndel1 in Neuronal Migration. Neuron. 2010 Nov 18; 68(4): 695–709.

3. Tasic B, Hippenmeyer S, et al.Site-specific integrase-mediated transgenesis in mice via pronuclear injection. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 May 10; 108(19): 7902–7907.

4. Tasic B, Miyamichi K,et al.Extensions of MADM (Mosaic Analysis with Double Markers) in Mice. PLoS One. 2012; 7(3): e33332.

5. Beard C, Hochedlinger K, et al. Efficient method to generate single-copy transgenic mice by site-specific integration in embryonic stem cells.Genesis. 2006 Jan;44(1):23-8.

6. Hochedlinger K, Yamada Y, et al.Ectopic Expression of Oct-4 Blocks Progenitor-Cell Differentiation and Causes Dysplasia in Epithelial Tissues. Cell. 2005 May 6;121(3):465-77.

7. Zeng H, Horie K, et al. An inducible and reversible mouse genetic rescue system. PLoS Genet. 2008 May; 4(5): e1000069.

8. Linda Madisen, Aleena R. Garner, et al. Transgenic mice for intersectional targeting of neural sensors and effectors with high specificity and performance. Neuron. 2015 Mar 4; 85(5): 942–958.



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