Science重磅| 南模生物助力曹雪涛团队发现首个核内DNA感受器


病毒入侵宿主时,宿主表达的模式识别受体(Pattern recognition receptors,PRRs)可以识别病毒,激发适应性免疫以清除病原体,此为固有免疫。在PRRs中,胞质DNA感受器(包括cGAS,DDX41,DAI,AIM2,IFI16等)研究较为广泛[1-4],特别是陈志坚教授及其团队发现的cGAS酶[1],可以识别外源的双链DNA(如病毒),催化生成环鸟腺苷酸分子(cGAMP),激活干扰素刺激蛋白STING,从而激发细胞的免疫和炎症反应,这就是目前免疫研究领域炙手可热的明星通路cGAS-STING。以上所说免疫反应发起点发生在细胞质中,当病原性DNA入核之后,是否存在类似的DNA感受器可以感知外源性DNA以激活免疫反应仍然长期充满争议。

就在2019年7月18日,Science在线发表了南开大学曹雪涛院士团队的科研成果“Nuclear hnRNPA2B1 initiates and amplifies the innate immune response to DNA viruses”。该研究发现了细胞核内的新型DNA感受器——hnRNPA2B1,它可以在核内识别病原性DNA,形成同源二聚体,被脱甲基酶JMJD6去甲基后,易位到细胞质中,进而激活TBK1-IRF3信号通路,促使IFN-α/β的产生。在此过程中同时还会促使免疫关键因子cGAS,IFI16和STING的mRNA的N6-甲基腺苷(m6A)修饰,翻译及核质转移,进一步确保IFN-α/β的活化。

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南模生物为该研究构建了关键的Hnrnpa2b1fl/fl小鼠模型。

研究人员首先从被HSV-1(Herpes simplex virus-1,单纯孢疹病毒)感染的AW264.7细胞核提取物中沉淀出HSV-1基因组DNA结合蛋白,通过质谱分析获得潜在的23个候选蛋白,通过siRNA功能实验,筛选出所谓的DNA感受器蛋白——hnRNPA2B1。

在Hnrnpa2b1-KO的AW264.7细胞中,被HSV-1感染后,干扰素Ifnb1的表达明显降低,且同时HSV-1的复制能力增强。

除了体外实验,研究人员还构建了Hnrnpa2b1骨髓细胞特异性敲除小鼠(Hnrnpa2b1fl/fl;Lyz2-Cre+/–),发现在被HSV-1感染后,其原发性腹膜巨噬细胞(PMs)中IFN-β的转录水平及分泌能力都显著下降,同时伴随着脑内更高的病毒滴度及其更高的死亡率(Fig1)。

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Fig. 1. hnRNPA2B1 activates antiviral defense to inhibit DNA virus replication.

在明确了Hnrnpa2b1的功能之后,接下来就要搞清Hnrnpa2b1如何发挥作用。利用Hnrnpa2b1fl/fl;Lyz2-Cre+/–小鼠,研究人员发现hnRNPA2B1缺失后TBK1和IRF3的磷酸化水平受显著下降。接着,研究人员又发现hnRNPA2B1在HSV-1感染后发生了二聚化,驱动其从细胞核到细胞质的易位,从而通过Src结合并活化TBK1-IRF3信号通路,启动STING依赖的IFN-α/β的表达。

另外,研究人员还分析了hnRNPA2B1特定位点的去甲基化(Arg226)对整个免疫反应的影响。早前研究认为,巨噬细胞被HSV-1感染后,hnRNPA2B1的R226位点会发生去甲基化。而在Hnrnpa2b1敲除的RAW264.7细胞中过表达hnRNPA2B1-R226A相对于过表达野生型hnRNPA2B1来讲,在经过HSV-1感染后,前者(hnRNPA2B1-R226A是非甲基化状态)IFN-β的mRNA水平和蛋白水平将有更大幅度的上升(Fig2),这就意味着hnRNPA2B1在Arg226位点的去甲基化在整个免疫反应中有重要作用,且确定了去甲基化过程与去甲基化酶JMJD6有关。

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Fig.2 Arg226 demethylation is essential for hnRNPA2B1-mediated type I IFN induction.

最后,研究人员还发现hnRNPA2B1的缺失会导致Cgas,p204,Sting在细胞核内滞留且m6A修饰水平严重下降(Fig3),进而导致这些重要的免疫蛋白翻译效率下降。

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Fig3 hnRNPA2B1 facilitates m6A modification and nucleocytoplasmic trafficking of CGAS, IFI16, and STING mRNAs upon DNA virus infection.

 

在明星蛋白cGAS之外,研究人员终于找到了新型的核内DNA感受器--hnRNPA2B1,为固有免疫反应基础研究增添了新的维度,对了解核内免疫机理,寻找新的免疫治疗方法提供了重要的理论依据和参考资料。

 

 

参考文献

1. Sun L, Wu J, Du F, Chen X, Chen ZJ (2013) Cyclic GMP-AMP synthase is a cytosolic DNA sensor that activates the type I interferon pathway. Science 339: 786-791.

2. Takaoka A, Wang Z, Choi MK, Yanai H, Negishi H, et al. (2007) DAI (DLM-1/ZBP1) is a cytosolic DNA sensor and an activator of innate immune response. Nature 448: 501-505.

3. Zhang Z, Yuan B, Bao M, Lu N, Kim T, et al. (2011) The helicase DDX41 senses intracellular DNA mediated by the adaptor STING in dendritic cells. Nat Immunol 12: 959-965.

4. Unterholzner L, Keating SE, Baran M, Horan KA, Jensen SB, et al. (2010) IFI16 is an innate immune sensor for intracellular DNA. Nat Immunol 11: 997-1004.



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