8.31 | 小鼠“扰动图谱”讲座

要阐明小鼠基因功能，需要将其在小鼠敲除（扰动），观察其结果。 长期以来，我们对小鼠基因功能的研究处于低通量的水平,每次只能敲除、表征一个基因。而小鼠体内编码蛋白的基因有2万个，可以想象基因研究花费的时间之长、费用之高、速度之慢。

那如何高通量地完成小鼠基因功能研究？上海科技大学池天课题组融合Cre 和 Cas9 这两大体系，成功研发了高通量体内原位基因解码策略iMAP（inducible Mosaic Animal for Perturbation），并快速鉴定了90个基因在39种组织的基本功能，构建了世界首张小鼠“扰动图谱”。这项工作于今年7月份发表在Cell杂志上：Large-Scale Multiplexed Mosaic CRISPR Perturbation in the Whole Organism  。

本期《遇见科学家》栏目，我们非常荣幸邀请到上海科技大学池天教授做客南模生物直播间，同大家介绍iMAP的原理和应用。通过本次公益分享，我们期望与更多学者进行学术交流，共同促进基因生物学领域的研究。

2022年8月31日 19:00

1. iMAP原理

2. 应用举例

2.1 扰动图谱：单个品系揭示上百个基因在全身各种组织的功能

2.2 原位CRISPR筛选：快速发现肿瘤免疫疗法新靶点

2.3单基因打靶品系制备：高通量、廉价、快速

3. 前景

3.1 全基因组、泛组织、单细胞水平的扰动图谱

3.2 系统性筛选药物靶点和发现老药新用途

3.3 覆盖全基因组的条件性单基因打靶品系

池天 教授
上海科技大学-生命科学与技术学院

1987年本科毕业于复旦大学。1996年博士毕业于美国加州大学洛杉矶分校。1996至2003年在美国斯坦福大学从事博士后研究。2003-年至历任耶鲁大学助理教授、副教授、研究科学家、客座教授。2015年至今任上海科技大学教授。

研究方向：基因功能与技术 ，肿瘤免疫疗法

池天课题组长期关注技术革新，研发了一系列基因解码、操纵技术，包括条件性点突变、可逆打靶和碱基编辑，并将其用于科学发现。目前聚焦以下课题：

1. 描绘全基因组、泛组织、单细胞水平的“扰动图谱”：利用iMAP，在单细胞水平揭示小鼠2万个蛋白编码基因敲除后分别对全身500多种细胞的影响，从而使今后探索基因的基本功能变得像查找基因序列一样简单。

2. 发现疾病新靶点，实现老药新用：很多疾病难以治疗， 原因是靶点不明，或者靶点已知但缺乏安全有效的药物。拟利用iMAP，发现疾病靶点，同时探索老药靶点在疾病中的新作用，实现“老药新用”，从而跳出新药研发之漫长、昂贵、痛苦的历程。