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【谱系示踪系列第三期】多重组酶介导的交叉报告基因方法

上期讲述的单重组酶报告基因系统只能依赖一个 Maker 来定位我们的目的细胞，如果没有特定细胞类型特有的基因，则无法通过常规方法对其进行特异性标记。往期推文：【谱系示踪系列第一期】基础细胞标记方式【谱系示踪系列第二期】单重组酶介导的多色报告系统方法但随着细胞分类的不断深入，我们往往需要两个甚至两个以

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谱系示踪的难点——基因标记的异位表达如何避免？（中）

在遗传谱系追踪实验的设计过程中，基因的异位表达往往需要我们着重关注的问题。目的启动子在非目的组织中的表达被称为异位表达。为了更精准的标记特定细胞类型，避免异位表达的影响，我们可以借助两个（甚至以上）的标记物进行标记，这时标记细胞就需要使用到多重组酶介导的遗传方法。图. 异位表达对谱系示踪的影响[1]

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Nature Communications | 谱系示踪技术揭示肝脏损伤和再生的秘密

谱系示踪技术 肝脏损伤 肝脏再生

利用基因敲入小鼠模型谱系示踪技术，中科院上海生命科学研究院营养科学研究所周斌课题组的研究论文揭示了在肝脏损伤和再生过程中，这两类细胞的细胞动力学过程。该成果发表于2016年11月18日的Nature Communications杂志上，题为“Mfsd2a+ hepatocytes repopulate the liver during injury and regeneration”。

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Nature Medicine | 更精准的谱系示踪技术问世

谱系示踪技术 DeaLT 系统 DeaLT-IR系统

2017年11月13日，Nature Medicine 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果“Enhancing the precision of genetic lineage tracing using dual recombinases ”。该研究将 Dre-rox 重组系统引入到传统的基于 Cre-loxP 重组系统的遗传谱系示踪技术中，有效地规避了由于 Cre 表达的不特异性而导致的非特异性（“异位”）同源重组，实现了更为精准的遗传谱系示踪，为发育、干细胞及再生等领域的深入研究奠定了可靠的技术基础。上海南方模式生物作为共同作者单位，为该研究构建了10种小鼠模型：IR1, IR2, NR1, NR2, CAG-DreER, Tnni3-Dre, Tnnt2-Dre, Alb-CreER, CK19-Dre 和 Alb-DreER。

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遗传谱系示踪新技术

本期我们非常荣幸邀请到了周斌研究员做客我们上海南模生物直播间，为大家讲解他是如何建立了基于双同源重组酶系统的遗传谱系示踪新技术，并利用该技术巧妙地解决了多个领域内的重要科学问题。

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想搞懂谱系示踪课题设计，收藏这一篇就够了

想做细胞命运的相关研究，但谱系示踪的东西又繁琐又复杂？刚开始设计课题，已经被各类Cre/Dre工具鼠的介绍文献搞晕了，这该怎么办呢？别担心，本篇推文从实验设计思路开始，帮您梳理谱系示踪中各类工具的应用。Step 1了解谱系示踪是什么？谱系示踪，通常是指使用各种手段对某类祖细胞亚群进行标记，在后续时间

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JCI | 谱系示踪技术揭示心脏修复再生中新血管形成的机制

血管内皮细胞 心脏修复 新生血管

2017年6月26日，中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组在国际学术期刊《 Journal of Clinical Investigation》上发表了题为“Preexisting endothelial cells mediate cardiac neovascularization after injury”的论文，揭示了成体心脏修复再生中新生血管的来源。

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Nature Medicine | 谱系示踪技术揭示c-kit+干细胞的在肺的生理稳态和损伤修复过程中的作用

c-kit细胞 肺功能恢复

2015年7月13日，国际学术期刊Nature Medicine在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所周斌研究组的最新研究进展 “c-kit+ cells adopt vascular endothelial but not epithelial cell fates during lung maintenance and repair”，该研究利用遗传谱系示踪技术揭示了c-kit+干细胞的在肺的生理稳态和损伤修复过程中的作用。

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Circulation Research | 谱系示踪技术揭示胚胎期冠状动脉的起源

静脉窦 冠状动脉起源

国际知名学术期刊《Circulation Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所周斌研究组的最新研究成果“Endocardium minimally contributes to coronary endothelium in the embryonic ventricular free walls”。该研究利用遗传谱系示踪技术揭示了心血管研究领域内长期存在的争论性问题，为研究冠状血管的发生发育与再生治疗提供了理论基础。

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Nature Communications | 谱系示踪技术探索心肌致密化不全的发病机制

心肌致密化不全 心脏的发育

2017年7月20日，《Nature Communications 》发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组题为“ Identification of a hybrid myocardial zone in the mammalian heart after birth ”的最新研究，研究中采用谱系示踪技术发现了哺乳动物心脏发育过程中心肌致密化的新机制。

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