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谱系示踪的难点——基因标记的异位表达如何避免?(中)

在遗传谱系追踪实验的设计过程中,基因的异位表达往往需要我们着重关注的问题。目的启动子在非目的组织中的表达被称为异位表达。为了更精准的标记特定细胞类型,避免异位表达的影响,我们可以借助两个(甚至以上)的标记物进行标记,这时标记细胞就需要使用到多重组酶介导的遗传方法。图. 异位表达对谱系示踪的影响[1]

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Circulation Research | 谱系示踪技术揭示胚胎期冠状动脉的起源

静脉窦 冠状动脉起源

国际知名学术期刊《Circulation Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所周斌研究组的最新研究成果“Endocardium minimally contributes to coronary endothelium in the embryonic ventricular free walls”。该研究利用遗传谱系示踪技术揭示了心血管研究领域内长期存在的争论性问题,为研究冠状血管的发生发育与再生治疗提供了理论基础。

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【谱系示踪系列第三期】多重组酶介导的交叉报告基因方法

上期讲述的单重组酶报告基因系统只能依赖一个 Maker 来定位我们的目的细胞,如果没有特定细胞类型特有的基因,则无法通过常规方法对其进行特异性标记。往期推文:【谱系示踪系列第一期】基础细胞标记方式【谱系示踪系列第二期】单重组酶介导的多色报告系统方法但随着细胞分类的不断深入,我们往往需要两个甚至两个以

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Circulation Research | 谱系示踪技术揭示心内膜细胞的血管潜能

心内膜 冠状血管

2018年1月26日,Circulation Research在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果“Genetic Fate Mapping Defines the Vascular Potential of Endocardial Cells in the Adult Heart”的文章,揭示了成年人心脏中心内膜细胞再生冠状动脉血管的潜能。本研究中Npr3-CreER小鼠由上海南方模式生物构建。

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Circulation│c-kit 细胞对成体心肌细胞贡献的再评价

c-kit CSCs 成体心肌细胞

7月8日,国际学术期刊Circulation在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组与中国医学科学院阜外医院心血管疾病国家重点实验室聂宇课题组的最新科研成果“Reassessment of c-Kit+ Cells for Cardiomyocyte Contribution in Adult Heart”。

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Science | 南模生物助力周斌团队解密成体肝细胞的真正来源

谱系示踪

2月26日,国际学术期刊 Science 以 Research Article形式在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)周斌研究组的研究成果“Proliferation tracing reveals regional hepatocyte generation in liver homeostasis and repair”。南模生物为该研究构建了关键的Ki67-CreXER2小鼠模型。

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Nature Medicine | 更精准的谱系示踪技术问世

谱系示踪技术 DeaLT 系统 DeaLT-IR系统

2017年11月13日,Nature Medicine 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果“Enhancing the precision of genetic lineage tracing using dual recombinases ”。该研究将 Dre-rox 重组系统引入到传统的基于 Cre-loxP 重组系统的遗传谱系示踪技术中,有效地规避了由于 Cre 表达的不特异性而导致的非特异性(“异位”)同源重组,实现了更为精准的遗传谱系示踪,为发育、干细胞及再生等领域的深入研究奠定了可靠的技术基础。上海南方模式生物作为共同作者单位,为该研究构建了10种小鼠模型:IR1, IR2, NR1, NR2, CAG-DreER, Tnni3-Dre, Tnnt2-Dre, Alb-CreER, CK19-Dre 和 Alb-DreER。

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【公开课】Cre-loxP 系统介绍及使用问题

Cre-loxP Cre-loxP系统 条件性敲除

大咖来袭!上海南模生物副总经理孙瑞林博士,具备多年 Cre 工具鼠研发和使用经验,将就“ Cre-loxP 系统介绍及使用问题”这一主题进行一场免费网络直播讲座,在线为您解答以上问题。

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Dev Cell | 南模生物助力揭示心脏内皮细胞发育谱系

心脏 内皮细胞 细胞发育 细胞谱系

南模生物为该研究构建了WT1-mGFP和Nfatc1-aGFP-N-tTA基因修饰小鼠。

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Science文章:南模生物助力周斌组建立邻近细胞遗传学技术揭示体内细胞间相互作用

南模生物为该研究提供了Tnnt2-mGFP, Alb-mGFP, Cdh5-aGFP-N-tTA, R26-mGFP, Pdgfra-aGFP-N-tTA, H11-aGFP-N-tTA, tetO-Dre-BFP 和 Tigre-synNotch 小鼠。

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