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谱系示踪的难点——基因标记的异位表达如何避免?(上)

通常,细胞类型中基因的激活不是“有”或“无”,特定的基因标记意味着启动子的活性在这种细胞类型中相对较高,而在其他细胞中,目的启动子也可能被弱激活,这种现象也被叫做异位表达。异位表达对谱系追踪的影响很大,常常会导致一些关于细胞命运的争议。

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谱系示踪的难点——基因标记的异位表达如何避免?(中)

在遗传谱系追踪实验的设计过程中,基因的异位表达往往需要我们着重关注的问题。目的启动子在非目的组织中的表达被称为异位表达。为了更精准的标记特定细胞类型,避免异位表达的影响,我们可以借助两个(甚至以上)的标记物进行标记,这时标记细胞就需要使用到多重组酶介导的遗传方法。图. 异位表达对谱系示踪的影响[1]

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Circulation | 利用DeaLT技术揭示成人心肌细胞再生的来源

DeaLT技术 心肌细胞

4月26日,国际学术期刊Circulation在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的研究成果“Genetic Lineage Tracing of Non-myocyte Population by Dual Recombinases”。

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小鼠的遗传谱系追踪玩法,你搞懂了吗?

南模生物长期关注谱系示踪模型,具有丰富的模型资源,点击了解详情。

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想搞懂谱系示踪课题设计,收藏这一篇就够了

想做细胞命运的相关研究,但谱系示踪的东西又繁琐又复杂?刚开始设计课题,已经被各类Cre/Dre工具鼠的介绍文献搞晕了,这该怎么办呢?别担心,本篇推文从实验设计思路开始,帮您梳理谱系示踪中各类工具的应用。Step 1了解谱系示踪是什么?谱系示踪,通常是指使用各种手段对某类祖细胞亚群进行标记,在后续时间

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扒一扒那些小鼠肿瘤模型

恶性肿瘤的发生率与死亡率依然居高不下,可以毫不夸张的说,抗肿瘤是一场旷日持久没有硝烟的战争。从化疗到靶向治疗,再到免疫治疗,科学家们想尽一切办法来战胜肿瘤,而无论哪一种方法,都离不开一样秘密武器——小鼠肿瘤模型。

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【首例Nigri-nox重组酶工具鼠】谱系示踪新利器

同源重组 重组酶

8月15日,国际学术期刊Development在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果“Dual genetic tracing system identifies diverse and dynamic origins of cardiac valve mesenchyme”。 该研究首次基于Nigri-nox同源重组构建转基因工具小鼠,并利用基于Nigri-nox和Cre-loxP系统构建了更为精准的双同源重组系统,具有能够在体内同时标记并示踪两群独立的干细胞群能力,并利用此新系统揭示了心脏瓣膜间充质细胞的起源及动态变化。Nigri-nox系统与传统的Cre-loxP系统相结合在体内的成功应用为发育、疾病和再生研究提供了更多的技术选择。 研究所用世界首只体内受Nigri-nox系统调控的转基因工具小鼠——Cdh5-Nigri小鼠,和R26-NLR(Rosa26-nox-loxP-reporter)示踪小鼠均由南模生物构建。

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【Natrue Protocols】深度解读DeaLT谱系示踪技术

2018年9月24日,Nature Protocols发表了中科院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究员课题组的文章“Genetic lineage tracing of resident stem cells by DeaLT”,详细描述了如何利用DeaLT这种新型谱系示踪系统来进行细胞命运与组织发育的研究。

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谱系示踪的难点——基因标记的异位表达如何避免?(下)

通常,细胞或组织中的特异性 Marker 意味着启动子的活性在这种细胞类型中相对较高,而并非在其他细胞中完全不表达。在其他细胞中,目的启动子也可能被弱激活,这种现象也被叫做异位表达。异位表达对谱系追踪的影响很大,常常会导致一些关于细胞命运的争议。

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Nature Genetics | 南模生物助力揭示心内膜起源的成纤维细胞调控心脏纤维化

南模生物为该研究构建了多种基因修饰小鼠:R26-LSL-RSR-tdT-DTR, Tnnt2-Dre-Cre-tdTomato, Npr3-tTA以及Col1a2-RSR-CreER等。

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