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想搞懂谱系示踪课题设计,收藏这一篇就够了

想做细胞命运的相关研究,但谱系示踪的东西又繁琐又复杂?刚开始设计课题,已经被各类Cre/Dre工具鼠的介绍文献搞晕了,这该怎么办呢?别担心,本篇推文从实验设计思路开始,帮您梳理谱系示踪中各类工具的应用。Step 1了解谱系示踪是什么?谱系示踪,通常是指使用各种手段对某类祖细胞亚群进行标记,在后续时间

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【谱系示踪系列第一期】基础细胞标记方式

细胞谱系追踪技术通常是指使用各种手段对某类祖细胞亚群进行标记,在后续时间点对其分化命运进行检测,它对于揭开多样的、基础的生物学过程中的分子机制是非常关键,因此一直以来建立能够在体内进行追踪细胞谱系的动物模型是生物学研究的一个长期目标。图. 谱系追踪策略[1]自1990年代初以来,基因修饰技术一直用于

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【谱系示踪系列第三期】多重组酶介导的交叉报告基因方法

上期讲述的单重组酶报告基因系统只能依赖一个 Maker 来定位我们的目的细胞,如果没有特定细胞类型特有的基因,则无法通过常规方法对其进行特异性标记。往期推文:【谱系示踪系列第一期】基础细胞标记方式【谱系示踪系列第二期】单重组酶介导的多色报告系统方法但随着细胞分类的不断深入,我们往往需要两个甚至两个以

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谱系示踪的难点——基因标记的异位表达如何避免?(上)

通常,细胞类型中基因的激活不是“有”或“无”,特定的基因标记意味着启动子的活性在这种细胞类型中相对较高,而在其他细胞中,目的启动子也可能被弱激活,这种现象也被叫做异位表达。异位表达对谱系追踪的影响很大,常常会导致一些关于细胞命运的争议。图.异位表达对谱系示踪的影响[1]上一期,我们讲述了双重组酶介导

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谱系示踪的难点——基因标记的异位表达如何避免?(中)

在遗传谱系追踪实验的设计过程中,基因的异位表达往往需要我们着重关注的问题。目的启动子在非目的组织中的表达被称为异位表达。为了更精准的标记特定细胞类型,避免异位表达的影响,我们可以借助两个(甚至以上)的标记物进行标记,这时标记细胞就需要使用到多重组酶介导的遗传方法。图. 异位表达对谱系示踪的影响[1]

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开学伊始,你的模式动物选好了吗!

又是一年开学时刻!鼠博士不禁哼起小调:美美September,手里握着课题,知识点汇聚交集,让我们来一起选动物模型~鼠博士为大家贴心总结了常见的问题,大家可以按需查看推荐模型:1. 如何研究目的基因的功能?→基因敲除鼠2. 如何研究目的基因点突变的功能?→点突变鼠3. 如何精准定位目的基因的表达区域

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高分利器|当单细胞测序遇到基因修饰小鼠……

有了单细胞测序数据,如何出其不意,发表高水平文章,冲击CNS,走上人生巅峰呢?用好基因修饰小鼠是您的不二选择。

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Nature Genetics | 遗传示踪结合条件敲除技术揭示肝脏血管新起源

VEGFA 肝脏血管 VEGFR2

2016年3月29日,国际学术期刊《Nature Genetics》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所周斌研究组的最新研究成果“Genetic lineage tracing identifies endocardial origin of liver vasculature”。该研究利用遗传示踪技术并结合组织特异性基因敲除技术,发现了部分肝脏血管在胚胎发育期起源于心脏中的心内膜细胞,并揭示VEGFA/VEGFR2信号通路参与调控肝脏血管的生成和肝脏的器官生长,为血管细胞谱系的建立与发育调控研究提供了新的视角和思路。

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Nature Genetics | 南模生物助力揭示心内膜起源的成纤维细胞调控心脏纤维化

南模生物为该研究构建了多种基因修饰小鼠:R26-LSL-RSR-tdT-DTR, Tnnt2-Dre-Cre-tdTomato, Npr3-tTA以及Col1a2-RSR-CreER等。

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Cell Discovery | 周斌团队合作开发邻近细胞遗传操作新技术

近期,国科大杭州高等研究院周斌教授团队合作研究成果“Intercellular genetic tracing by alternative synthetic Notch signaling”在国际学术期刊Cell Discovery上发表。

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