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谱系示踪的难点——基因标记的异位表达如何避免?(中)

在遗传谱系追踪实验的设计过程中,基因的异位表达往往需要我们着重关注的问题。目的启动子在非目的组织中的表达被称为异位表达。为了更精准的标记特定细胞类型,避免异位表达的影响,我们可以借助两个(甚至以上)的标记物进行标记,这时标记细胞就需要使用到多重组酶介导的遗传方法。图. 异位表达对谱系示踪的影响[1]

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【老鼠新发现】巧用谱系示踪技术洞察肝脏再生的秘密

肝可以再生吗 肝能再生吗

2月14日,国际学术期刊Stem Cell Reports在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果“Lineage Tracing Reveals the Bipotency of SOX9+ Hepatocytes during Liver Regeneration”。该研究利用双同源重组系统(Cre-loxP和Dre-rox)结合多种小鼠损伤模型揭示了SOX9+肝细胞可以作为肝损伤后的双能祖细胞,为肝脏的修复和再生研究提供了新的方向和理论基础。

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Cell Research | Cre-loxp系统揭秘 m6A RNA 修饰如何调控精子发生

m6A修饰 精子发生

2017年9月15日,Cell Research 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所童明汉研究组的研究成果 “Mettl3/Mettl14-mediated mRNA N6-methyladenosine modulates murine spermatogenesis”。该研究绘制了小鼠不同发育阶段生精细胞的 m6A RNA 修饰图谱,揭示了 m6A RNA 修饰通过调控精子发生过程中关键基因的转录后翻译,从而控制精子发生的分子机制。文中 Stra8-GFPCre 小鼠由南模生物构建。

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Nature Genetics | 南模生物助力揭示心内膜起源的成纤维细胞调控心脏纤维化

南模生物为该研究构建了多种基因修饰小鼠:R26-LSL-RSR-tdT-DTR, Tnnt2-Dre-Cre-tdTomato, Npr3-tTA以及Col1a2-RSR-CreER等。

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JCI | 谱系示踪技术揭示心脏修复再生中新血管形成的机制

血管内皮细胞 心脏修复 新生血管

2017年6月26日,中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组在国际学术期刊《 Journal of Clinical Investigation》上发表了题为“Preexisting endothelial cells mediate cardiac neovascularization after injury”的论文,揭示了成体心脏修复再生中新生血管的来源。

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【Natrue Protocols】深度解读DeaLT谱系示踪技术

2018年9月24日,Nature Protocols发表了中科院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究员课题组的文章“Genetic lineage tracing of resident stem cells by DeaLT”,详细描述了如何利用DeaLT这种新型谱系示踪系统来进行细胞命运与组织发育的研究。

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Science | 南模生物助力周斌团队解密成体肝细胞的真正来源

谱系示踪

2月26日,国际学术期刊 Science 以 Research Article形式在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)周斌研究组的研究成果“Proliferation tracing reveals regional hepatocyte generation in liver homeostasis and repair”。南模生物为该研究构建了关键的Ki67-CreXER2小鼠模型。

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Nature Medicine | 更精准的谱系示踪技术问世

谱系示踪技术 DeaLT 系统 DeaLT-IR系统

2017年11月13日,Nature Medicine 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果“Enhancing the precision of genetic lineage tracing using dual recombinases ”。该研究将 Dre-rox 重组系统引入到传统的基于 Cre-loxP 重组系统的遗传谱系示踪技术中,有效地规避了由于 Cre 表达的不特异性而导致的非特异性(“异位”)同源重组,实现了更为精准的遗传谱系示踪,为发育、干细胞及再生等领域的深入研究奠定了可靠的技术基础。上海南方模式生物作为共同作者单位,为该研究构建了10种小鼠模型:IR1, IR2, NR1, NR2, CAG-DreER, Tnni3-Dre, Tnnt2-Dre, Alb-CreER, CK19-Dre 和 Alb-DreER。

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Cell | 南模生物助力肺泡干细胞在肺修复和再生中的来源追踪研究

南模生物为该研究定制了R26-RL-NICD-GFP、Sftpc-mGFP-DTR基因修饰小鼠模型。

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